鰭是魚類的主要運動器官和平衡身體器官。一般魚類的背鰭、臀鰭和尾鰭位於身體兩側的正中，不成對為單葉，它們合稱為奇鰭（單個的意思）；胸鰭和腹鰭位於身體的兩側，每側各一個，是成對的，它們合稱為偶鰭（成對的意思）。
金魚除色澤變化最大外，就是鰭的變化，它們的鰭大多變為寬、長或退化或短小，或分裂成雙葉、四葉等，臀鰭則有單、雙之分，也有無臀鰭的。鰭的變化是區別金魚品種的主要特徵之一：
（1）背鰭：
魚類背鰭的作用是維持身體直立的平衡器官，使魚身不易左右傾斜。金魚分為有背鰭的種類和無背鰭的種類:
有背鰭種類——一般文種金魚、草金魚、部分龍睛、高頭、獅頭等均有背鰭，且背鰭較寬大。
無背鰭種類——這樣的品種稱蛋種金魚。蛋種金魚的背部圓滑，雖無背鱗，但其身短，略呈蛋形，尾鰭分成左右相等的兩葉，同樣能維持身體的平衡。
有殘缺背鰭的種類——即背鰭沒有完全退化掉，還存在幾根鰭條，這種金魚，一般在幼魚時就被淘汰了。不過近來也有漁場少部分保留下來作成鯊魚壽。
（2）胸鰭：
靠近鰓蓋處長有一對胸鰭，主要的作用是轉換方向及划水，在繁殖季節也可做為辨別雌雄的標誌，雄魚鰭條上會出現追星，而雌魚則不出現。 （3）腹鰭：
在胸鰭與臀鰭之間長有一對腹鰭，雖然起不到游泳的作用，卻可以用來做出準確的機動動作,魚健康時，腹鰭向外伸展，當腹鰭收縮靠近腹部時，說明此魚的健康狀況出現問題，需要引起足夠的重視。
（4）臀鰭：
臀鰭的作用和背鰭大致相同。金魚的臀鰭位於肛門之後，有的種類具有單臀鰭（例如草金魚），在其他各品種中，不同的個體有雙臀鰭的，也有單臀鰭或無臀鰭的，一般人認為、有雙臀鰭的為優良性狀，但具單臀鰭的個體並不受到淘汰，沒有臀鰭的個體一般在幼魚時就被淘汰了。
（5）尾鰭：
魚類的尾鰭有推進和轉向的作用。金魚的尾鰭變化多端，尾鰭是否對稱、優美與否，基本能決定這尾金魚的優劣位置。金魚的尾鰭大致可分為以下幾種:
單尾鰭——有長尾和短尾之分，例如草金魚的尾鰭是短尾單尾，燕尾金魚的尾鰭是長尾單尾。
雙尾鰭——又稱開放尾。在胚胎期，肛門後的皮膚分叉，發育成開放尾，根據分叉的多少，開放尾又分為兩種:
三葉尾——上面兩片尾葉相連，下面兩葉分開，形成三葉尾。
四葉尾——上、下兩片尾葉都分開，形成四葉尾。