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作者：竹子
導言：單細胞測序技術自 2009 年問世，2013 年被 Nature Methods 評為年度技術以來，越來越多地被應用在基礎科研和臨床研究等方面。單細胞測序從單個細胞水平對基因組和轉錄組進行研究，通過全基因組或轉錄組擴增，進行高通量測序，能夠揭示單個細胞的基因結構和基因表達狀態，反映細胞間的異質性，相比於群體細胞測序，更適用於解決少量特殊樣本的研究、異質性群體的分析及同時或互斥發生的基因組變化的查找等問題。
單細胞測序在腫瘤、發育生物學、臨床診斷、免疫學、微生物學、神經科學、大規模細胞圖譜構建、細胞亞群細化&稀有細胞類型鑑定、幹細胞發育及分化等領域有重要應用，是目前研究的焦點。
單細胞技術應用領域
來源：火石創造
目前，最常見的單細胞測序的應用是在腫瘤研究上。以下為小編總結的2020年的相關研究：
2020.6.25
新的DNA測序技術可能有助於揭示癌症腫瘤的遺傳多樣性
南加州大學（USC）研究人員使用基於微流體滴的單細胞測序方法，同時對近1,500個單細胞的基因組進行了測序，揭示了先前隱藏在經過充分研究的黑色素瘤細胞系中的遺傳多樣性。這項發表在《自然通訊生物學》上的研究證明了單細胞測序揭示癌細胞可能進化軌跡的能力。
DOI：10.1038 / s42003-020-1044-8
2020.6.2
研究人員確定小細胞肺癌中的移動目標
在《癌細胞》雜誌上，俄勒岡大學科學家們概述了有關小細胞肺癌肺癌亞型起源的新發現，為研究該疾病的新基礎鋪平了道路。他們開發了一種新的測定方法，使研究小組能夠追蹤腫瘤樣本中的單個細胞，並觀察它們隨時間的變化。這一發現也可能有助於理解其他已知具有亞型的癌症，例如乳腺癌或成膠質細胞瘤。研究小組推測，其他癌症的亞型也可能代表了腫瘤進化的階段。
DOI：10.1016 / j.ccell.2020.05.001
2020.4.27
研究發現，免疫系統改變發生在多發性骨髓瘤的早期發展
波士頓達納·法伯癌症研究所、麻省理工學院與哈佛大學的一項研究發表在《自然癌症》上，是朝著多發性骨髓瘤的更個性化治療邁出的一步。這項新研究代表了單細胞RNA測序的首次應用。
DOI：10.1038 / s43018-020-0053-3
2020.4.17
單個細胞分裂錯誤可能觸發一系列具癌症特徵的突變
美國和英國多個機構的一組研究人員發現，細胞分裂過程中的一個錯誤會觸發一系列突變事件，從而產生癌症基因組中的許多特徵。該小組在《科學》雜誌上發表的論文中，描述了使用活細胞成像和單細胞全基因組測序，來研究單細胞突變事件對下游細胞發育的影響。這項新的研究表明，細胞分裂的一個單一錯誤可能導致一系列突變，從而產生許多癌症基因組中所見的複雜性。
總的來說，這項發現確定了一系列機制，可以解釋單個未修復的DNA斷裂破壞基因組完整性的巨大潛力。這一發現為癌症的病因學提供了一些見識，可能會促進新的研究來預防與著色桿菌病相關的突變。
DOI：10.1126 / science.aba0712
2020.1.29
CLL治療的單細胞測序：共享基因方案，患者個性化執行
奧地利科學院（CeMM）分子醫學研究中心領導的研究小組，使用單細胞測序和表觀遺傳學分析方法對靶向白血病治療的反應進行了詳細研究。該論文發表在《自然通訊》雜誌上。他們結合了免疫表型分析、單細胞轉錄組分析（scRNA-seq）和染色質定位（ATAC-seq）的方法，共同監測慢性淋巴細胞性白血病（CLL）細胞和免疫系統其他細胞類型的活性、調控和表達。在開始使用靶向抗癌藥物依魯替尼治療的CLL患者中發現了精確的分子程序。儘管該程序被所有患者共享，但其執行速度差異很大。研究結果有助於制定個性化策略，以將CLL作為一種老年人的慢性疾病進行管理。
DOI：10.1038 / s41467-019-14081-6
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