肩袖損傷後脂肪浸潤基因表達譜及關鍵通路的生物信息學分析

中國組織工程研究雜誌 發佈 2021-08-12T02:05:36.529025+00:00

文題釋義:肩袖損傷後脂肪浸潤:是肩袖修補術後失敗的關鍵因素之一,其與再撕裂率和功能預後密切相關。脂肪浸潤多發生在肩袖撕裂後1年內,萎縮的肌肉組織被脂肪組織替代,並向鄰近組織侵襲,影響肌肉及肌腱的質量及力學特性。

文題釋義:

肩袖損傷後脂肪浸潤:是肩袖修補術後失敗的關鍵因素之一,其與再撕裂率和功能預後密切相關。脂肪浸潤多發生在肩袖撕裂後1年內,萎縮的肌肉組織被脂肪組織替代,並向鄰近組織侵襲,影響肌肉及肌腱的質量及力學特性。

基因本體分析(Gene ontology,GO):是通過對生物學的3個方面——細胞組分(cellular component)、分子功能(molecular function)、生物過程(biological process),將差異基因從功能、參與的生物途徑及細胞中的定位進行了標準化描述,即對基因產物進行了簡單注釋。

背景:脂肪浸潤是肩袖修補術後失敗的關鍵因素,然而肩袖損傷後脂肪浸潤的病理變化機制尚不清楚。

目的:旨在探索肩袖損傷後關鍵基因的表達差異,確定其功能和機制通路,為肩袖損傷脂肪浸潤的病理變化機制提供理論依據。

方法:通過GEO資料庫獲取GSE93661晶片篩選差異表達基因,採用GO、KEGG分析脂肪浸潤的潛在機制。通過構建PPI網絡獲取樞紐基因,分析潛在致病靶點。

結果與結論:共鑑定差異表達基因471個。GO和KEGG分析表明神經活性配體-受體相互作用、細胞黏附分子通路是肩袖損傷脂肪浸潤的潛在機制。白三烯B4受體(LTB4R)作為PPI網絡中的樞紐基因,可能是肩袖損傷脂肪浸潤的關鍵靶標。提示:文章發現了肩袖損傷後脂肪浸潤病理髮展中潛在的關鍵基因和通路,為今後的治療提供了參考方向。

https://orcid.org/0000-0003-1261-6120(劉沛東)

中國組織工程研究雜誌出版內容重點:組織構建;骨細胞;軟骨細胞;細胞培養;成纖維細胞;血管內皮細胞;骨質疏鬆;組織工程

關鍵詞: 肩袖損傷, 脂肪浸潤, 差異基因, 生信信息學, GEO資料庫

引用本文:劉沛東, 馮江峰, 徐文杰, 許曉棟, 楊自權. 肩袖損傷後脂肪浸潤基因表達譜及關鍵通路的生物信息學分析[J]. 中國組織工程研究, 2021, 25(11): 1773-1778.

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