B肝兩對半和肝功能是完全不同的指標，一般來說，B肝患者病情進展容易出現肝功能異常;但是肝功能異常的患者不一定就是B肝患者，很多疾病都可以造成肝功能異常的。
B肝難治的各種因素，B肝患者中有部分患者，「肝功」反覆異常。「肝功」反覆異常或長期異常的患者，絕大多數後期都會形成肝硬化或肝癌。有效地治療B肝「肝功」反覆異常，是防止肝硬化和肝癌發生的重要手段。
一、HBV感染後發病與變化
據有關研究資料表明感染B肝病毒(HBV)後，經過6——24周的潛伏期發病，出現症狀(睏倦乏力、懨油膩、胸悶、脘痞、腹脹、口苦、口乾，或肌膚鞏膜黃染、尿黃……)，「肝功」異常者為「急性」期;經過半年以上的潛伏期發病出現症狀;「肝功」異常者為「慢性」期：長期潛伏不發病，形成無症狀;「肝功」正常，「兩對半」、「DNA」檢測又呈陽性者為「隱性」患者。
(一)人體感染HBV有由接觸、蚊子，醫源(肌內注射、針灸、創傷縫合……)，從肌表傳入和由母體垂直傳播與輸血直接進入血分兩種傳播途徑。HBV若由肌表傳入，氣分首先受邪，氣屬陽，陽主動、主升，病變部位淺，所以經過6——24周的潛伏後發病出現症狀，「肝功」異常者的「急性」期。「急性」B肝若得到急時正確治療，症狀消除，「肝功」恢復正常，多數患者可以轉陰。若治療不急時或得不到正確治療，則病毒內陷營分轉為「慢性」;若在治療過程中過用苦寒之品，損傷陽氣則病毒內陷血分變證為「隱性」。
(二)HBV若由母體垂直傳播或輸血直接進入血分者，血屬陰，陰主靜、主藏，病變部位深，所以長期潛伏不發病，形成無症狀，「肝功」正常，「兩對半」、「DNA」檢測呈陽性的「隱性」患者。「隱性」B肝外遇感冒高熱，過度疲勞，過食辛辣和暴飲酒食及藥物刺激都可能使病毒活躍，外出氣分而發病出現症狀，「肝功」異常，變為『慢性』。
二、肝功反覆異常的原因
感染HBV後若病毒在半表半里之間營分受邪，營為陰中之陽，居於氣分與血分之間，外受氣分陽熱之影響不得不發病，內受血分陰寒之氣的影響又不會急時發病，所以經過半年以上的潛伏期後才會發病，出現症狀，「肝功」異常，形成了氣、營同病。
由於現代醫學對B肝「肝功」反覆異常所出現的膽紅素，轉氨酶升高也和「急性肝炎」一樣採取退黃、降酶的對症療法，雖然，黃退，酶降，「肝功」恢復正常。但是營分的病毒未徹底清除或內陷血分，在氣分陽熱的不斷影響下又逐漸活躍外出氣分，出現症狀，「肝功」再次異常，周而復始，形成了「肝功」反覆異常。
三、陽毒與陰毒
B肝「肝功」反覆異常的患者，出現「膽紅素」、「轉氨酶」升高時，臨床上則有著寒、熱的不同臨床表現。實踐證明由於臨床表現不同，病的性質也不相同，故筆者認為，由於人的體質有強弱，陰陽有盛衰不同，人體感染B肝病毒，若陽盛之人或溫熱內蘊之人感染HBV後，病毒則從熱化形成「陽毒」，症見：肌膚鞏膜黃染，色黃鮮明如橘子色，心煩口渴、口乾、口苦、睏倦乏力、失眠多夢、齦衄、舌苔黃膩或舌紅無苔或少苔，大便乾燥或塘垢，脈弦滑數。