根據牛頓在1704年的一封書信上的記載，他解釋在公元800年神聖羅馬帝國的查理曼大帝之後的1260年，就是世界的末日。
報導稱，伊薩克·牛頓是近代科學家中最傑出的代表人物，被譽為「現代科學之父」。然而，就是這樣一位被一隻蘋果砸中腦袋就悟出地心引力的科學天才，竟將後半生的寶貴時間全部花費在神學上，研究起所謂的《聖經密碼》來。不過，由於大多數牛頓神學手稿都在上世紀30年代的一個拍賣會上被一位名叫亞伯拉罕·
雅胡達的神秘收藏家買走，這些手稿後來的下落一直不為世人所知，因此後世科學家也根本無從知道牛頓窮半生之力，到底在手稿上算出了些什麼。
直到日前，耶路 撒冷希伯萊民族博物館的研究人員竟然在館藏中發現了這些塵封的牛頓手稿，在數千頁寫得密密麻麻的紙上，研究人員看到牛頓嘗試用複雜的公式破譯所謂「聖經密碼」，並試圖計算宇宙的「末日」時期。
讓研究人員目瞪口呆的是，這位嚴謹的科學家在複雜枯燥的算式最後，竟在一張字跡潦草的紙上將世界末日定於2060年！
手稿上，牛頓預言世界末日的到來 將伴隨著瘟疫和戰爭的爆發，並預言聖人到時將再次降臨地球，他自己可能也將成為聖人之一。研究人員由此認為，晚年的牛頓對神學的痴迷程度顯然已「病入膏 肓」了。
隨著牛頓手稿「驚人內容」的披露，一部有關加拿大學者研究牛頓生平的紀錄片《牛頓：黑色異教徒》也將在英國播出，英國再次掀起一股「牛頓熱」。
該片導演尼奧姆接受記者採訪時稱：「我們想了解作為神學家的牛頓到底是個什麼樣的人——他花費了大約50年的時間寫下了4500頁研究手稿，試圖預言 世界末日何日到來。但是到目前為止，我們不知道他是否真寫下了這樣一個最後的數字。我認為對那個年代的牛頓來說，這是不可能做到的一件事。即使他真算出個 什麼數字，這個數字也不可靠。」
牛頓死後270多年，一位以色列數學家伊利雅胡·瑞普斯和物理學家多倫·維茨頓通過電腦數學運算程式來研究聖經，不久後發表出一篇《創世紀等距離字母順序解碼》的論文，稱他們已經用計算機發現了真正的「聖經密碼」。
反對論學者認為伊利雅胡·瑞普斯所研究的聖經原文已經跟古抄本有一定的差別，包括句點和字距等都不一樣，瑞普斯用計算機算出的所謂「聖經密碼」，只不過是一種斷章取義的「撞大運」罷了。
整本聖經希伯萊文有30多萬個字母，起碼可以發生100億種字母組合，若按自己的意思隨便斷字，相信還會找到更多五花八門的東西，如果有朝一日「聖經密碼」研究者從聖經中找到諸如黛安娜去世、Windows2000問世的預言，他們也一點不會感到驚訝。