自然流產是一個複雜的問題，如果反覆流產二次以上，即是習慣性流產。原因之一就與染色體異常有密切關係。在一般情況下，一個生育期的婦女，若連續二次自然流產，經常用檢測手段沒有發現疾病者，應考慮夫婦中某一方是否染色體異常。
染色體異常並不罕見，大約人群中每五百人就可能有一人是染色體易位。染色體易位，是在人類個體「複製信息」的染色體上存在著許許多多決定遺傳性狀的基因，這種遺傳基因「信息」若發生異常，或斷裂、或缺失、或「嫁接」到其他染色體上，將本來長短、結構正常的染色體性狀改變，這樣就會發生不幸。異常的染色體假如產生於精子之中，這種帶病的精子與正常的卵子結合，則形成一個具有先天缺陷的受精卵。受精卵開始即使可以在宮腔內成話一段時間，但活力極差，往往在胚胎早期就會夭折，發生死胎與流產，難以成活到分娩。
據臨床觀察，約有二分之一的自然流產是由於染色體異常所致。由於精子的變異、劣質，受孕的結果常常是屢次懷孕屢次流產。其實，這是自然的選擇、優生的需要。染色體異常，不僅僅局限於男性，女性的染色體也會發生。
之所以人類好端端的生殖細胞，精子中染色體會發生異位，原因是多方面的。到目前為止，醫學界對這一問題的研究尚沒有十分確切的結論。不過，大多數學者認為，染色體易位與內分泌紊亂有關，特別是育齡較大的女性，很容易導致卵子染色體易位。除此之外，濫用藥物、大氣污染、飲食污染、電磁波污染、放射線污染等等，也是導致染色體易位的常見因素。
在歐洲一些國家就已經發現,在7-8月份懷孕的農民婦女中，染色體發生異常者明顯高於其他月份的婦女，這是由於夏季接觸殺蟲劑及除草劑污染了她們食用的糧食、蔬菜、水果，造成了生育上的「悲劇」。還有人觀察過，冬天在懷孕前後使用電熱毯的夫婦，發生自然流產者有增多趨勢，這有可能與精子或卵子遭受電熱、電磁波污染有關。
生殖細胞中染色體異常的原因是多方面的。凡是染色體異常導致的流產，胎兒一般是保不住的，即使保住也是崎形兒，因而不要盲目保胎。染色體異常之後，一般沒有理想的治療方法，人們能夠做到的是，部分患者是可以找到發病原因，凡是屬於藥物所致、飲食污染、電磁波污染，可以盡力避免;如果是男性內分泌異常所致，就應當進行系統檢查，找出具體原因，有針對性地治療。這種治療不是發生在出現染色體之後，而是在發生之前的治療與預防。