腧穴的選取和配伍是針灸治療疾病的重要環節，並直接關係到治療效果的好壞。
選穴配穴方法是以陰陽、臟腑、經絡等學說為依據，通過辨證立法，結合腧穴的功能、特性，並遵循一定的基本規律。
（一）選穴原則
選穴原則主要包括近部選穴、遠部選穴和隨證選穴。
1.近部選穴近部選穴是指選取疾病所在部位或鄰近部位的腧穴。針灸治療疾
病較為注重近部選穴，即在病變部位就近選穴以調整受病經絡、器官、組織的氣血，使之平衡。如偏頭痛取太陽；近視取四白、承泣；面神經麻痹取陽白、地倉；上瞼下垂取魚腰、陽白等。
2.遠部選穴遠部選穴是指選取距離病痛較遠處部位的腧穴，這是因為腧穴具有遠治作用的特點。人體許多腧穴，尤其是四肢肘、膝關節以下的經穴，不僅能治療局部病證，而且還可以治療本經循行所及的遠隔部位的病證。如胃脘痛取足三里：面神經麻痹取合谷等；同時根據疾病的病理變化，既可取所病臟腑經脈的本經腧穴，也可取表里經或其他相關經脈上的腧穴，如痤瘡屬肺系病汪，可選取手太陰肺經的太淵、孔最，同時還可選取手陽明大腸經的合谷。
3.隨證選穴亦名對證取穴，是指針對某些全身症狀或疾病的病因病機選取穴位，如高熱取大椎；或運用有些腧穴對某一方面病證的特殊治療效果，如角孫治療腮腺炎。
（二）配穴方法
配穴方法是在選穴原則的基硎上，選取兩個以上具有協同作用的腧穴加以配伍應用的方法。配穴方法主要包括本經配穴、表里經配穴、上下配穴、前後配穴和左右配穴等。
1.遠近配穴法:即選穴原則巾的「近部選穴」與「遠部選穴」配合使用的方法，如而神經麻痹用陽白、地倉，是近取法；取合谷是遠取法。將遠近兩者配合起來使用，能起到更好的治療效果．
2.上下配穴法:是指將腰部以上腧穴和腰部以下腧穴配合應用的方法。上下配穴法在臨床上應用廣泛，如治療腳癬取百會．足三里；治療咽喉痛、牙痛取合谷、內庭；脫髮取頭維、豐隆等。
3.表里配穴法:本法是以臟腑、經脈的陰陽表里配合關係，作為配穴依據。即某一臟腑經脈有病，取其表里經腧穴組成處方施治，如肥胖症取足陽明胃經的足三里，足太陰脾經的陰陵泉。
4.左右配穴法:是指選取肢體左右兩側腧穴配合應用的方法，在針灸治療損美性疾病時經常應用，如左側面癱，取左側頰車、地倉，並配合右側合谷等。
5.前後配穴法:前指胸腹，後指腰背。選取前後部位腧穴配合應用的方法稱為前後配穴法，俞募配穴法亦屬本法範疇。凡治臟腑疾患，均可採用此法。例如，胃痛前取中脘、梁門，後取胃俞、胃倉。