急性傳染病，中醫稱之為「瘟疫」，大面積爆發的叫「大疫」。
中國古代典籍如《周禮》《左傳》《黃帝內經》，都有大量的關於瘟疫的描述。僅漢代《五行志》所載較為嚴重的疫情就有9次之多。
三千年前的《黃帝內經.素問.刺法論》雲:「五疫之至，皆相染易，無問大小，病狀相似。」最早描述了瘟疫的特徵。《禮記.月令》云：「孟春行秋令則民大疫；季春行夏令則民多疾疫；仲夏行秋令則民殃於疫；仲冬之月，地氣沮泄......民必疾疫。」最早認識到瘟疫發生與氣候反常有關。漢代王充《論衡.命義》云：「溫氣疫癘，千戶滅門。」巢元方《諸病源候論·卷十》說：「人感乖戾之氣而生病，則病氣轉相染易，乃至滅門。」說明瘟疫發病死亡率極高。
東漢張仲景說：「余宗族素多，向餘二百。建安紀年以來，猶未十稔，其死亡者，三分有二，傷寒十居其七。」張仲景因此棄官從醫，著《傷寒雜病論》，成為醫聖。
特別是曹植《說疫氣》云：「建安二十二年，癘氣流行，家家有殭屍之痛，室室有號泣之哀。或闔門而殪，或覆族而喪。或以為：疫者，鬼神所作。夫罹此者，悉被褐茹藿之子，荊室蓬戶之人耳！若夫殿處鼎食之家，重貂累蓐之門，若是者鮮焉。此乃陰陽失位，寒暑錯時，是故生疫，而愚民懸符厭之，亦可笑也。」明確指出：癘氣流行，並非鬼神所作，而是陰陽失位，寒暑錯時所致。這些都充分說明中醫對急性傳染病的研究非常早，認識也很到位，在世界醫學史上處於絕對領先地位。
據不完全統計，在中國歷史上曾經爆發過1400多次瘟疫，大規模的有321次。因為有中醫科學防控，從來沒有發生過整個城市死亡的狀況。無獨有偶，在西方歷史上也曾爆發過許多大規模的瘟疫，如西班牙大流感、歐洲黑死病、全球鼠疫，幾乎每一次瘟疫死亡人數都達到數千萬人，有些城市人都死光了。古希臘、古羅馬帝國的命運都因瘟疫而改變。
為什麼中國防控瘟疫可以獨領風騷呢？因為中國醫藥學的歷史5000年從未中斷，中醫理論肇始於《黃帝內經》，一以貫之到如今，《傷寒論》《瘟疫論》《溫病條辨》《溫熱經緯》《傷寒溫疫條辨》《傷寒指掌》《肘後備急方》等溫病學專著形成了完善的瘟疫防治理論體系，至今指導臨床實踐。張仲景、吳鞠通、葉天士、吳又可、王孟英、楊栗山等溫病大家燦若繁星。
在大量歷史事實面前，「中醫黑」們卻數典忘祖，硬說中華民族五千年繁衍昌盛成為世界第一人口大國，是中國人命大福大，與中醫無關。或者生拉活扯把中醫幾千年防疫的功勞往西醫頭上套。殊不知西醫是公元1300年文藝復興後才形成並逐步發展起來的，傳入中國也就一百多年的歷史，就連西方預防天花的種痘術也是從中國輸入的。
中醫防治瘟疫主要有四大絕活。一是可以預測發病。《黃帝內經》五運六氣學說推測氣候變化、瘟疫發病很準，指導臨床實踐很有用。二是強調提前預防。《黃帝內經》提出「聖人不治已病治未病」，主張對外要「避其毒氣」「虛邪賊風，避之有時」，特彆強調「不能傳者，正氣存內，邪不可干」。三是辨證論治。同一種瘟疫由於發病季節氣候地點不一樣，病人體質不一樣，發展階段不一樣，治療方法處方用藥也不一樣。四是善後調理。大病初癒，病人臟腑陰陽氣血虧虛，需要及時進行調理恢復。
中醫藥在傳染病防治方面的獨特療效，說遠了有人可能不信，現代的歷次傳染病暴發疫情，中醫藥每一次都發揮了不可替代的作用。例如：1945年夏秋之交，成都地區麻疹暴發流行，死亡率極高，蒲輔周從運氣學說分析當年夏秋成都大雨連綿，濕遏熱伏，麻疹郁而難發，按濕溫治法用三仁湯加香薷通陽利濕，使得濕開熱越、疹毒透出，疫情得到及時控制。1960年代廣東麻疹大流行，也是採用中醫中藥才及時控制了疫情蔓延。
1956年秋，北京爆發乙腦疫情，兒童醫院、傳染病醫院住滿了患者。一開始用石家莊治療乙腦的經驗（白虎湯）不僅無效，病情反而加重，死亡率非常高。衛生部點將蒲輔周任專家組組長，蒲老仔細辨識後認為，石家莊的乙腦是暑溫，而北京當年秋雨綿綿、濕熱氤氳，乙腦證屬濕溫，於是採用通陽利濕，芳香化濁法，疫情迅速得到遏制。1956年9月4日《健康報》在頭版以「運用中醫溫病治療原則治乙型腦炎——北京市不少危重腦炎患者轉危為安」為題報導。
特別是2003年「非典」肆虐，關鍵時刻，中醫挺身而出，廣東省中醫院接治「非典」患者50多人全部治癒，小湯山醫院中醫藥治療「非典」也捷報頻傳。中醫藥治療費用低，治癒者亦無後遺症。吳儀副總理高度評價中醫是抗擊非典型肺炎的重要力量，WHO的充分認可中醫藥對非典的顯著療效，WHO代表施賀德說「否定中醫是無知的傲慢」。
美國蘭德公司是當今世界最負盛名的戰略決策諮詢機構。2003年在其題為《新出現和再度出現的傳染病對全球的威脅》的報告中明確指出：受全球化、現代醫療實踐和農業活動導致的不良後果，人類行為方式的變化以及環境因素等的影響，傳染病不可控制的蔓延已取代來自敵對國家直接的軍事威脅，成為國際社會及各國政府面對的嚴峻挑戰。現代科學雖然高度發展了，但今天疾病的性質及威脅程度比過去任何時候都嚴重得多，不僅有近幾年突發的從前未曾想像到的致命疾病如愛滋病，還有幾十年前出現過並被認為已得到控制的疾病又捲土重來，如結核病，並且毒性更大，抗藥性更強。《報告》強調，這是因為現代醫療研究的性質和導向，越來越偏向對微生物的大規模的滅活，打破了微生物與人類之間精確的生理平衡而造成的。如對此不加以重視，對一個國家的功能運轉和安全造成的負面影響將是毀滅性的。與西醫對抗療法不同，中醫強調「天人相應」，注重辨證論治，在治療病因不明疾病和多因素疾病方面具有不可取代的優勢。中醫主張人與自然(包括細菌、病毒等)和諧共處，通過中藥、針灸等多種方法，調整、激發人體組織的康復能力來祛病健身，不專與細菌、病毒搞對抗，這正是醫學未來的發展方向。
蘭德公司的報告對當今傳染病不可控制蔓延帶來的嚴峻挑戰、產生原因、嚴重後果分析深刻，對中西兩種醫學的觀點方法、發展方向論述精準。蘭德公司發布這個報告之後，SARS、禽流感、口蹄疫、手足口病、登革熱、伊波拉、寨卡等重大傳染病陸續來襲，值得我們深刻反思。在上述重大傳染病防治中，中醫藥從未缺席，良好的療效一次又一次得到國際社會廣泛認可。
當前，新型冠狀病毒肺炎從武漢蔓延到全國乃至全球，來勢洶洶，防控形勢非常嚴峻，已經嚴重影響到全國人民的生產生活和生命安全。中醫藥人又一次義無反顧，挺身而出，必將大獲全勝，凱旋而歸，再一次書寫新的輝煌歷史。
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