本次檢查發現有28家工廠存在工業廢水未經處理直排市政污水管網及河涌，典型如：鄭龍五金、宏慶豆腐廠、輝盛包裝、多義金屬、廣州市德利機電有限公司、廣州市荔聯環保再生能源有限公司等。同時多家企業生產管理不規範，工作人員環保意識淡薄，工業廢物處置不當等問題突出，部分廠家涉嫌無證無照經營。
根據水質檢測結果，何香凝工業區總排污口及宏慶豆腐廠排污口水質嚴重超標。何香凝工業區總排污口（市政主管）COD值（化學需氧量，COD的數值越大表明水體的污染情況越嚴重）為1.57×105，超過污水排入城鎮下水道水質標準限值300倍，氨氮109超過限值2倍，動物植物油4.72×104超過限值470倍；宏慶豆腐廠排污口（排水戶出水口）COD值為3.33×103超過限值5倍多，氨氮值為78超過限值1倍多。
37宗污染線索移交屬地查處
本次檢查共發現22家生產企業無工業廢品處置合同、19家無相關環評手續、10家無有效排水排污證，同時有4家無法現場提供相關證照，此外廣州力晟食品有限公司在無取水證的情況下私自抽取河水用於淋花、降溫。
廣州市河長辦於檢查當日交辦發現的污染線索（37宗），由荔灣區河長辦協調屬地鎮街，生態環境分局、農水局及市場監督管理分局等職能部門跟進查處。
根據荔灣區河長辦關於污染源查控行動的初查情況報告，各職能部門已於交辦當天責令工廠停止污染行為，並持續跟進整治污染線索；區生態環境分局擬立案查處6宗，區農水局擬立案查處1宗。區生態環境分局要求相關排污企業立即停止違法排污行為，封堵違法排污口，完成企業備案，同時要求對工業廢物統一收集妥善處置。
根據廣州市河長辦現場摸查統計結果，荔灣區菊樹涌及其支涌存在11處巡河通道不貫通。阻斷巡河通道的建築物包括廠房（3處）、居民住宅（4處）、商鋪（2處）、倉庫（1處）、圍牆（1處），隔斷通道長度從數十米到數百米不等。