基因鑑定監測病毒變異趨勢 信息技術實現快速申報 滬大數據技術賦能防疫精準有序

新民晚報 發佈 2020-02-14T11:19:04+00:00

確診新冠病毒之後,是否隔離到位及時攔截了病毒傳播,能否知曉病毒變異趨勢,為藥物和疫苗研發指明方向…新民晚報記者馬亞寧

確診新冠病毒之後,是否隔離到位及時攔截了病毒傳播,能否知曉病毒變異趨勢,為藥物和疫苗研發指明方向……面對病毒肆虐,我們努力從跟著病毒「追跑」,變為搶先病毒「領跑」。在此過程中,大數據技術正在助我們跑出「加速度」。今天上午,擁有大數據特長的上海科技創新資源數據中心,在線面向全國醫療機構、醫生和醫學研究者提供推出一項免費服務:提供病毒基因組測序鑑定服務。這一服務能夠幫助醫院和醫生繞到病毒背後一看究竟,為臨床診斷和治療提供參考,為全面分析研究病患的呼吸道病毒組、研究其致病因子提供支撐。

大數據支撐病毒基因組鑑定

在當下疫情防控的攻堅階段,精準的基因組測序對每一位病患及奮戰在抗疫一線的醫務工作者來說,都是有效、及時進行診療的重要依據。上海科技創新資源數據中心利用自身的大數據和雲計算平台發揮技術特長,第一時間聯合中國科學院上海巴斯德研究所、中國科學院上海營養與健康研究所,共同研發了基於二代測序數據的病毒基因組鑑定服務。

「根據病患的呼吸道樣本二代測序數據,通過分析流程將樣本數據與病毒基因庫進行快速比對,3小時便可檢測出包括SARS、COVID-19等在內的所有人類已知基因組的病毒。」中心戰略部科學數據產品經理左天宇告訴記者,病毒基因組鑑定與核酸檢查相比,優勢在於不僅可精準識別病毒基因特性,還能監測病毒變異趨勢並及時做出更新判定。

「希望病毒基因組鑑定所形成的鑑定分析結果能幫助更多的醫院、醫生進行臨床診斷和治療提供參考,同時為疫情防控、疾病診治、藥物篩選、疫苗設計與藥物研發和對病毒朔源、變異進化、致病機理等研究工作提供重要支撐。」上海科技創新資源數據中心CTO張嘉銳說。

大數據與病毒「殊死賽跑」

疫情發生以來,在看不見摸不著的數據空間裡,無數微不足道的「比特」匯聚而成大數據,與病毒展開了「殊死賽跑」。1月28日,在「一網通辦」總門戶、「隨申辦」APP、「隨申辦」小程序同步上線「一網通辦」新型肺炎防控專欄。目前共接入相關服務事項25個,其中包括:來滬人員健康登記、確診患者涉及區域及場所查詢、網上問診、發熱門診醫療機構查詢等熱門服務。截至2月12日,「一網通辦」各渠道防控專欄訪問量累計已超119.4萬次,其中移動端各渠道累計訪問量超過117.6萬次。

疫情防控關鍵期,減少人員跑動和集聚,要讓數據多跑路。根據疫情防控指揮部的安排,上海市大數據中心開發的「企業復工人員網上登記系統」和「解除醫學措施查詢系統」也於昨天上線。用戶利用電腦或手機,通過「一網通辦」總門戶、「隨申辦」APP、「隨申辦」兩個小程序或者健康雲平台、進入新冠肺炎防控專欄,選擇「解除醫學措施查詢」服務,輸入姓名、身份證號,即可查詢到醫學觀察措施和結束時間。

據上海市大數據中心主任朱宗堯介紹,「企業復工人員網上登記系統」依託本市大數據資源平台,對接健康雲平台數據,通過數據賦能,提供員工返滬日期、員工是否為風險人員信息等,實現了一次填報、多次復用。特別對於用工人員較多的企業,還開發了二維碼,員工可以通過掃碼,由系統自動採集信息,系統自動匯總上報,最大限度降低企業填報負擔,為企業加強疫情防控,合理安排復工復產提供支撐。

新民晚報記者 馬亞寧

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