培育健壯的優良品種苗木，是核桃優質高效生產的基礎。過去我國絕大部分核桃產區採用實生繁殖苗木。由於核桃是雌、雄同株，異花授粉，其實生苗遺傳基礎較複雜，後代分離很大，不同單株間的產量、結果早晚、果實品質差異明顯，如早實核桃用種子繁殖，其後代只有40%表現3年內開花。隨著核桃嫁接技術的突破和成熟，嫁接繁殖已成為核桃無性繁殖的主要手段。
一、砧木種類
1、普通核桃 即共砧。一般用夾核桃、小核桃等，優點是嫁接親和力強，接口容易癒合。我國北方地區普遍採用。
2、核桃楸 又叫楸樹，山核桃等。主要分布在我國東北和華北各省。此砧木抗寒耐旱，生長勢旺，適應性強。核桃楸幼苗不抽條，但嫁接成活率和保存率不如共砧高。
二、砧木種子的採集與貯藏
1、種子的採集
播種用的種子必須充分成熟，才能具備較強的生活力。核桃果實成熟的標誌是：青果皮由綠變黃（或黃綠色），果實頂端出現小裂口，青果皮極易剝離，此時即可採收。但作為種子用的，以青果皮自然開裂，種子（堅果）自行脫出為最好。在少雨地區，可每天從樹下揀拾，然後晾乾；多雨地區，為便於採收貯藏，可於全樹有50%左右果實開裂時一次性採收。
2、種子的貯藏
核桃種子採收後，除一部分直接播種外，大部分需經貯藏後才能播種。貯藏的關鍵就是要長時間保持種子原有的生活力。所以一般以把種子貯藏在5℃左右的低溫，50%～60%的相對濕度和通風良好的環境下為宜。否則，不利的環境條件會使核仁發生一系列化學變化而迅速失去生活力。貯藏有干藏和濕藏兩種方法。
干藏。將脫去青皮的核桃堅果放在乾燥通風的地方陰乾，干至隔膜一折即斷，內種皮與種仁不易分離，種仁顏色內外一致時便可貯存。若無陰乾條件而必須晾曬時，應避免將種子攤在石板、鐵板、水泥地面上且經強日光曝曬，以免因溫度過高使種子失去發芽力。
將乾燥的種子裝入麻袋，堆放於通風、陰涼、乾燥、日光不能直射進的房內貯藏。貯藏期間要經常注意檢查，以防鼠害、霉爛、發熱等現象發生。
濕藏。即濕砂貯藏。地點的選擇以地勢較高、排水良好、避風背陰處較為適宜。貯藏坑的大小視種子的多少而定。一般坑深0.7～1.0米、寬1.0～1.5米，長度按貯藏量決定。北方寒冷地區的坑宜深些，較暖地區可適當淺些。
貯藏坑挖好後，在坑底先鋪一層細濕砂，厚約10厘米，砂的濕度以手握成團但不出水為度。上擺一層核桃，坑四周和核桃之間填充濕砂。上再鋪砂（厚約10厘米）放種，如此層層上埋，在距坑口10～20厘米時，再蓋濕砂與地面平，砂上培土成屋脊形，應比坑口寬些，四周可開排水溝，以免雨水浸入坑內使濕度過大引起種子霉爛。坑過長時，可每隔2米在坑內插一把秸稈，以利空氣流通。坑上覆土厚度：寒冷地區要厚些，較暖地區可薄些，以最冷時種子不致受凍為度。
濕砂埋藏的種子，可以帶青皮，也可以用干種，但干種砂藏時應先用冷水浸種2～3天後再埋藏，剛脫去青皮的種子埋藏時可不用浸種。
濕砂貯藏的種子，出苗整齊，苗勢健壯，但若濕度掌握不好種子容易發生霉爛，應注意勤檢查，並在春季適時播種。