《南少林三十六房》（nanshaolin）是由袁祥仁執導，徐達初、郭俊立、朱可欣編劇，袁詠儀、吳京、張鐵林等主演的古裝武俠劇，由福建世紀長龍影視文化發展公司出品。
《南少林三十六房》講的是，弘曆受雍正之命暗訪倭寇內應，弘曆途中遇呂四娘襲擊。呂四娘父親呂留良當年被雍正所殺，呂四娘女扮男裝陸弘十找到當年父親好友「易神醫」曹太虛殺弘曆的故事。
吳京 飾 方世玉。 配音 張震。
袁詠儀 飾 呂四娘。配音 徐曉青。
張鐵林 飾 雍正。 配音 陸揆。
宋妍 飾 卓靈。 配音 紀元。
郭小安 飾 玄真。 配音 齊傑。
郭偉 飾 宮本鍵二。
周仲 飾 雲修。
孫蛟龍 飾 董海川。
故事始於圓明園。深夜，一個宮女在太醫掩護下，偷襲雍正寢宮，使雍正暴死，人頭丟了，下葬用金頭代替。乾隆繼位，多方追查刺殺雍正之人。雍正文字獄最大冤主呂留良家族唯一活口呂四娘被認為是割走雍正頭之人。
呂四娘逃脫後被獨臂神尼收為徒弟習武，長大後本事甚為了得。乾隆嚴命「雍正無頭案」不漏半點風聲，秘命四大侍衛南下追捕呂四娘。領頭者為伊爾根。呂四娘正和曹太虛在南方某小城，行醫賣藝。
雍正晚年崇尚金石之術，曹太虛是皇上身邊方士。乾隆志在必得，派特使快馬加鞭傳旨南少林，要派人暗中密查呂四娘和曹太虛下落，追回雍正人頭。特使找南少林老主持玄通大師，將皇上龍牌交與他，行事不得有誤。
南少林正熱火朝天準備三十六房主持競選，競選意義非同一般：誰當三十六房主持，就成南少林武功第一，也就是半個中國武功第一。最有實力者方世玉與雲明。
特使提議最後勝出者持龍牌抓人。按比武規則，世玉和雲明對決必有死傷，也延誤聖命。玄通宣布，二人比試點到為止，誰勝出誰就憑龍牌執行朝廷任務。雲明自知稍遜世玉，想在最後比試中陷害世玉，以奪得主持之位。
面臨變動，他順水推舟，比試中敗世玉手下。想趁機會，在世玉追查呂四娘行蹤途中殺世玉，栽贓給呂四娘。這樣他可穩坐三十六房主持之位。方世玉邀請兩位老朋友——「江湖老千」卓靈和「神偷」趙大宏一起踏上征程。
世玉的恩師、三十六房的創始人三德和尚早已被逐出南少林，得知世玉接受朝廷指派任務出行的消息後，悄悄跟隨世玉一行，暗中相助。泉州知府溫榮玉綽號「玉老虎」，與雲明勾結，欲在途中加害方世玉。
原來他與雲明都知曉世玉身上的一個秘密，那便是刺在他背上的一張「藏寶圖」。明朝正德年間，倭寇在南少林寺後山埋下了一批珍寶，價值連城。悉知此事的三德和尚將藏寶的地圖刻在世玉的後背上，沒有留下任何副本。
所以殺了世玉，雲明可得主持之位，玉老虎可拿著人皮地圖起獲珍寶。一舉兩得的事情，唯有聯手勝算最大。雲明和玉老虎想從世玉身邊的親密朋友下手，於是設計欲買通卓靈和趙大宏。
卓靈和趙大宏知道寶藏圖，卻瞞著世玉，打自己的算盤，三德和尚此次跟隨世玉的主要目的也是為了保護寶藏圖不落人他人之手。其實他並非真正被逐出少林，而是由玄通大師暗中安排在寺外接應南少林，並保護這批珍寶。
世玉喬裝打扮，和卓靈、趙大宏尋訪呂四娘，三德暗中幫助發現呂四娘和曹太虛行蹤。呂四娘被世玉蓋世氣質征服，芳心萌動。世玉也對呂四娘有好感，並和卓靈分析呂四娘可能是被人陷害。
卓靈見世玉偏袒女殺手，大為吃醋。伊爾根領頭的四大侍衛也找到呂四娘。他發現南少林弟子攪和此事中，發現世玉手中有皇上御賜龍牌，令他無法下手。才明白皇上讓四大侍衛和和尚一明一暗，追查人頭，殊路同歸。
因此，伊爾根怕世玉搶他的頭功，他要在追捕呂四娘途中還想同時殺死世玉，獨攬此功。但他萬萬想不到，行將方世玉滅口之際，呂四娘在關鍵時刻救了世玉一命。
雲明和玉老虎也追蹤寶藏圖至此。趙大宏和卓靈與雲明和玉老虎鬥智鬥勇，保護世玉同時隱瞞對那些珍寶的野心，所以也累也麻煩也快樂，神偷趙大宏差點被雲明陷害，中毒後昏迷不醒，卓靈為救大宏更被雲明推下懸崖。
四方糾葛時，乾隆首次南巡來到海寧。他正是為著雍正無頭案而來。他清楚呂四娘的能耐，為了更快解決這個案子，他分別召見世玉和伊爾根，下重賞，答應誰要是完成任務，就會得到黃金萬兩和世襲四品官職。
呂四娘和曹太虛也趕到海寧，行刺乾隆，終因乾隆也武功高強而未能成功。曹太虛犧牲，呂四娘負傷而逃。世玉也暗中掩護了呂四娘，阻擋了追殺的侍衛。世玉又為四娘療傷，還上了那次四娘救他一命的人情。
這件事情很快被敏銳的伊爾根發現，報告皇上。乾隆大怒，立命閩浙總督全力抓捕二人。世玉只好撇下自己的好朋友，與呂四娘一起出逃。在出逃過程中，呂四娘對世玉說出了自己刺殺雍正的前因後果。
世玉要她考慮江山社稷和平、百姓安寧穩定的重要，勸她自首。呂四娘不聽世玉勸告，兩人矛盾頓生，邊吵架邊鬧彆扭邊逃跑。在共患難的途中，呂四娘不可救藥地愛上了世玉……
最後四娘聲明只是為了世玉的安危才去朝廷投案自首。但被乾隆收押以後，呂四娘卻得知皇上並沒有信守諾言放過世玉，反而也將世玉押入大牢。呂四娘怒不可遏，越獄逃出並劫獄救出世玉，兩人約定一起去廣東。
乾隆十分惱怒，找南少林興師問罪，限定時日抓兩人，取玄通大師的首級。屢次撲空殺不了世玉的雲明逮此機會，將玄通囚禁，自命為南少林主持，將玄通交給皇上。皇上懷疑雲明所作所為。玄通點撥下，乾隆弄清來龍去脈。
他恢復玄通主持位置，表示如果案子不結，不抓到世玉四娘，就滅南少林！雲明倉皇出逃，去找世玉拚命，三德和尚在保護世玉中被雲明的暗器毒傷，命不過三天。雲明被救人心急的呂四娘就地解決，一命嗚呼。
三德將所有秘密和陰謀對世玉和盤托出，世玉遵照師傅遺囑，讓呂四娘將寶藏圖繪下，通過玄通大師獻給皇上，保住南少林。同時交玄通大師一封信，說要永遠離開南少林，和呂四娘去廣東山林海畔生活。